Comparison of parameter estimation methods in stochastic chemical kinetic models: Examples in systems biology
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
investigation of single-user and multi-user detection methods in mc-cdma systems and comparison of their performances
در این پایان نامه به بررسی روش های آشکارسازی در سیستم های mc-cdma می پردازیم. با توجه به ماهیت آشکارسازی در این سیستم ها، تکنیک های آشکارسازی را می توان به دو دسته ی اصلی تقسیم نمود: آشکارسازی سیگنال ارسالی یک کاربر مطلوب بدون در نظر گرفتن اطلاعاتی در مورد سایر کاربران تداخل کننده که از آن ها به عنوان آشکارساز های تک کاربره یاد می شود و همچنین آشکارسازی سیگنال ارسالی همه ی کاربران فعال موجود در...
Parameter inference for stochastic kinetic models of bacterial gene regulation: a Bayesian approach to systems biology
Bacteria are single-celled organisms which often display heterogeneous behaviour, even among populations of genetically identical cells in uniform environmental conditions. Markov process models arising from the theory of stochastic chemical kinetics are often used to understand the genetic regulation of the behaviour of individual bacterial cells. However, such models often contain uncertain p...
متن کاملA comparison among stochastic optimization algorithms for parameter estimation of biochemical kinetic models
Mathematical models in biochemical engineering field are usually composed by nonlinear kinetic equations, where the number of parameters that must be estimated from a set of experimental measurements is usually very high. In these cases, the estimation of the model parameters comprises numerical iterative methods for minimization of the objective function. Classical methods for minimization of ...
متن کاملComparison of finite difference based methods to obtain sensitivities of stochastic chemical kinetic models.
Sensitivity analysis is a powerful tool in determining parameters to which the system output is most responsive, in assessing robustness of the system to extreme circumstances or unusual environmental conditions, in identifying rate limiting pathways as a candidate for drug delivery, and in parameter estimation for calculating the Hessian of the objective function. Anderson [SIAM J. Numer. Anal...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: AIChE Journal
سال: 2014
ISSN: 0001-1541
DOI: 10.1002/aic.14409